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蛋白质相互作用网络中信号流向方向预测；根据网络的拓扑性质，挖掘网络重要节点（如hub节点，crosstalk节点）；根据功能信息注释，进行网络模块化

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1）普通线性肽，链长至189个氨基酸，毫克至克级，纯度可达99%2）简单修饰肽：免费提供N端乙酰化，末端酰胺化3）复杂修饰肽：脂肽，磷酸肽（Ser、Thr、Tyr），环肽（酰胺环、二硫键环），荧光标记肽（FAM、FITC），生物素标记肽（BIOTIN）、复合抗原肽（MAP）等 4）蛋白偶

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TMT和iTRAQ是目前常用的多肽体外标记定量技术。

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随着人类基因组计划的完成，越来越多的基因被发现，其中多数基因功能不明。利用表达系统在哺乳动物细胞内表达目的基因是研究基因功能及其相互作用的重要手段。

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代谢组学的研究一方面可以发掘一些新的分子标志物，另一方面通过与蛋白质组学、基因组学数据的联动分析，可以从原因和结果两方面分析生物体的内在变化，将系统生物学的研究推向更高发展水平。

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酶谱法的基本过程是先将样品进行SDS-聚丙烯酰胺(SDS-PAGE,含0.1%明胶)电泳分离

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